More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0047 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  71.2 
 
 
250 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  70 
 
 
250 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  68.8 
 
 
250 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  69.6 
 
 
256 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  58.8 
 
 
250 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  55.87 
 
 
249 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  44.54 
 
 
252 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  42.11 
 
 
256 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.22 
 
 
256 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
256 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
256 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
256 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
256 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
256 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
255 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
256 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  39.92 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 
257 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 
254 aa  192  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
243 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
259 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
230 aa  180  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
245 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  39.46 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  39.46 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.91 
 
 
257 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.47 
 
 
247 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  40.68 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  42.93 
 
 
251 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  40.59 
 
 
252 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  35.86 
 
 
247 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
246 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
250 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  39.5 
 
 
262 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  39.18 
 
 
246 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  42.44 
 
 
254 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36.52 
 
 
254 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.86 
 
 
249 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  34.14 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.96 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  43.84 
 
 
222 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  41.51 
 
 
284 aa  161  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  38.12 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
245 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  40.98 
 
 
258 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  39.37 
 
 
250 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  42.53 
 
 
239 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  40 
 
 
255 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  35.47 
 
 
259 aa  158  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
247 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  38.07 
 
 
262 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  39.81 
 
 
427 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  41.74 
 
 
262 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
254 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
254 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  39.91 
 
 
237 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.83 
 
 
271 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  38.24 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  38.24 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  36.56 
 
 
421 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  40.25 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
243 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  37.82 
 
 
259 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
245 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  38.07 
 
 
421 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  37.05 
 
 
254 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.67 
 
 
251 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
262 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
254 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.66 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.14 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  40.18 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  34.02 
 
 
258 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  34.25 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  38.94 
 
 
286 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
257 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  37.97 
 
 
242 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.13 
 
 
226 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.62 
 
 
244 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  36.19 
 
 
235 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  35.27 
 
 
421 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  32.91 
 
 
278 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
236 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
249 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
277 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  33.47 
 
 
252 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  36.94 
 
 
427 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
249 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  33.19 
 
 
256 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 
281 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
287 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  34.06 
 
 
221 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
249 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>