More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0401 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
249 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  44.44 
 
 
258 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  45.6 
 
 
258 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  45.6 
 
 
258 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  45.93 
 
 
262 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  46.09 
 
 
250 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
253 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  46.25 
 
 
294 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
254 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 
281 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.99 
 
 
260 aa  203  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
254 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  44.05 
 
 
254 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  40.65 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  42.74 
 
 
251 aa  198  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  44.77 
 
 
273 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 
251 aa  192  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  44.44 
 
 
257 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
256 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
256 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 
243 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
256 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.67 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  42.63 
 
 
254 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
254 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  43.11 
 
 
257 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 
255 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
260 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  42.73 
 
 
256 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  44.95 
 
 
222 aa  184  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
287 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  43.12 
 
 
259 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  40.31 
 
 
251 aa  178  9e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.44 
 
 
252 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2209  ATPase  44.44 
 
 
271 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.412133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  46.83 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  47.6 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.15 
 
 
258 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.16 
 
 
250 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
259 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  46.19 
 
 
256 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  41.33 
 
 
246 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
250 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  45.87 
 
 
268 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
260 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  43.4 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  39.09 
 
 
247 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  40.74 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  38.97 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.65 
 
 
262 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  42.33 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  41.35 
 
 
262 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.45 
 
 
271 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  39.84 
 
 
257 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.4 
 
 
247 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.97 
 
 
249 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  39.72 
 
 
254 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
249 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.9 
 
 
259 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  40 
 
 
240 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  40.93 
 
 
288 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  32.56 
 
 
249 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  44.49 
 
 
308 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
255 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
249 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.34 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
254 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
249 aa  155  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  40.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  43.2 
 
 
244 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  37.99 
 
 
261 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  37.99 
 
 
261 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  45.31 
 
 
259 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  41.12 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  37.21 
 
 
240 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  37.21 
 
 
240 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
284 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  39.37 
 
 
248 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
249 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  39.81 
 
 
262 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40 
 
 
250 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  40.29 
 
 
248 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.98 
 
 
263 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
284 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>