More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2985 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  78 
 
 		 256 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  68.8 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  62.8 
 
 		 250 aa  338  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  62.8 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  59.51 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  58.4 
 
 		 250 aa  295  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  45.16 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  42.17 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 		 257 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.67 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  39.42 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  43.85 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  42.57 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.19 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.55 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  38.57 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  38.57 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  35.34 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  35.68 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  45.75 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  42.47 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  40 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  41.44 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  36.18 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  41.98 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  42.5 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  40.28 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.09 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  35.24 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  34.62 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  38.14 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  44.59 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.61 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  31.87 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  39.23 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  36.73 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  36.73 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.16 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  41.39 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  41.15 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  39.3 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  40.64 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  44.39 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.43 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  39.71 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.53 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  36.56 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  36.68 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  35.38 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.87 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  35.02 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  34.33 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  35.95 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  37.9 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  34.69 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>