More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1192 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  62.71 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  55.64 
 
 
311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
250 aa  261  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
245 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  54.89 
 
 
246 aa  254  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  55.32 
 
 
246 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  57.33 
 
 
242 aa  228  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
256 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
256 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
256 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.74 
 
 
256 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  44.72 
 
 
256 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 
257 aa  198  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  42.68 
 
 
250 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.91 
 
 
252 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
259 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
260 aa  184  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
249 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  44.2 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  39.52 
 
 
249 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  42.15 
 
 
250 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  45 
 
 
255 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  43.64 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
250 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.55 
 
 
247 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  41.6 
 
 
254 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  44.24 
 
 
222 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.93 
 
 
251 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  46.95 
 
 
257 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
245 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.85 
 
 
247 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  40.85 
 
 
249 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
261 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  39.17 
 
 
255 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.45 
 
 
258 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
243 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.45 
 
 
258 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.62 
 
 
271 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
255 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  43.69 
 
 
251 aa  166  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
284 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  41.38 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
254 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.13 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  41.89 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.82 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.25 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.21 
 
 
254 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 
249 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  37.82 
 
 
250 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  43.87 
 
 
251 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 
249 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  38.86 
 
 
221 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 
251 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
254 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
256 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.51 
 
 
258 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
250 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  41.23 
 
 
243 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.96 
 
 
268 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
249 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  38.43 
 
 
261 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  38.43 
 
 
261 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
247 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  41.42 
 
 
251 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
257 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  45.07 
 
 
253 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  41.28 
 
 
254 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
259 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.92 
 
 
258 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 
260 aa  155  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  41.56 
 
 
263 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
249 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
249 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.73 
 
 
236 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.84 
 
 
262 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  40.43 
 
 
278 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  36.75 
 
 
240 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  38.68 
 
 
275 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.8 
 
 
418 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  40 
 
 
253 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  36.82 
 
 
252 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  37.76 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  38.14 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>