More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  100 
 
 
276 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  60.42 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  66.81 
 
 
279 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  62.61 
 
 
256 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  57.49 
 
 
286 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
262 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  57.55 
 
 
259 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
277 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  62.34 
 
 
278 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  54.1 
 
 
253 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  55.51 
 
 
253 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  54.43 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  53.09 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
247 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  51.98 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.73 
 
 
250 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
260 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.46 
 
 
254 aa  155  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  40.28 
 
 
252 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 
256 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  44 
 
 
258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
287 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.48 
 
 
256 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  40.51 
 
 
249 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  33.33 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  39.44 
 
 
254 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
255 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
255 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  39.22 
 
 
248 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  32.26 
 
 
246 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  39.82 
 
 
262 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  42.08 
 
 
271 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  37.8 
 
 
249 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  37.83 
 
 
250 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
261 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  37.91 
 
 
223 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
262 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
250 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 
249 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
249 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  42.5 
 
 
265 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.61 
 
 
259 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.45 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.61 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.17 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  37.56 
 
 
311 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  35.87 
 
 
221 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  39.34 
 
 
259 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.82 
 
 
250 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  37.67 
 
 
258 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.17 
 
 
258 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.73 
 
 
258 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  36.48 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  41.12 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  42.23 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  35.07 
 
 
250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  33.86 
 
 
261 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
259 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  33.86 
 
 
261 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  37.16 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  35.63 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.03 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.07 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.61 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  33.6 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.54 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  37.5 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  42.21 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.81 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  39.27 
 
 
245 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  38.65 
 
 
299 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  36.97 
 
 
298 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
265 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  42.15 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.7 
 
 
262 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  38.07 
 
 
263 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  37.39 
 
 
248 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  37.61 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>