More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0736 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  100 
 
 
277 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  63.71 
 
 
262 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  63.98 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  59.49 
 
 
259 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  59 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  59.83 
 
 
253 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  55.42 
 
 
276 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  54.44 
 
 
286 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  49.21 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
256 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
279 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  47.76 
 
 
259 aa  201  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
261 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  52.21 
 
 
278 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.38 
 
 
244 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  40.28 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 
254 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
255 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36.97 
 
 
254 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
258 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 
257 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35.42 
 
 
256 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
256 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
256 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.71 
 
 
247 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  39.51 
 
 
248 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.82 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.81 
 
 
262 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  36.95 
 
 
261 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  36.95 
 
 
261 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.01 
 
 
258 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  40 
 
 
251 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.65 
 
 
257 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
249 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.89 
 
 
256 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 
249 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.92 
 
 
250 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.07 
 
 
263 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  41.23 
 
 
249 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 
243 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.66 
 
 
228 aa  148  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  43.05 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40.98 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  41.13 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.38 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.53 
 
 
251 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  37.27 
 
 
263 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  41.43 
 
 
262 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  33.02 
 
 
264 aa  145  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
247 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  37.24 
 
 
251 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  37.79 
 
 
250 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.65 
 
 
268 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.53 
 
 
246 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
249 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
249 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
262 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
249 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  38.57 
 
 
250 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.95 
 
 
271 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.94 
 
 
236 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.98 
 
 
250 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  28.86 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  39.42 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  32.39 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  31.67 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  40.59 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  35.62 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
250 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.24 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
259 aa  138  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  40.54 
 
 
251 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
246 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  37.04 
 
 
271 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  41.52 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  38.59 
 
 
319 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
250 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.5 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  40.83 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.98 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  41.07 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1074  ABC transporter related  44.02 
 
 
252 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.281919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>