More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2048 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  62.55 
 
 
253 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  61.32 
 
 
253 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  61.9 
 
 
259 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  57.53 
 
 
287 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  55.56 
 
 
286 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  58.15 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  58.99 
 
 
264 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  52.89 
 
 
276 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  48.4 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  52.26 
 
 
256 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
261 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
279 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  51.42 
 
 
244 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  49.57 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
255 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  40 
 
 
252 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 
257 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.53 
 
 
256 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.07 
 
 
257 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 
254 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  38.84 
 
 
250 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.52 
 
 
250 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  37.83 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  35.45 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.55 
 
 
249 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
255 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  36.51 
 
 
247 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.49 
 
 
228 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  42.92 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
245 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 
256 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
245 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.17 
 
 
250 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  34.1 
 
 
259 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.65 
 
 
258 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.15 
 
 
258 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.82 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.15 
 
 
258 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  41.55 
 
 
262 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
250 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  44.39 
 
 
256 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
255 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  36.32 
 
 
264 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  38.07 
 
 
250 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.49 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  34.6 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  31.34 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  37.81 
 
 
261 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  37.81 
 
 
261 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  38.21 
 
 
258 aa  138  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.15 
 
 
268 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
248 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  42.98 
 
 
310 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  39.09 
 
 
271 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  41.63 
 
 
246 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.11 
 
 
252 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.84 
 
 
246 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.64 
 
 
262 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  35.95 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  38.36 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.29 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 
254 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 
254 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.27 
 
 
273 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  38.97 
 
 
248 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.74 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  37.62 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  38.01 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.91 
 
 
271 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
262 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  40.3 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
254 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.4 
 
 
249 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  32.52 
 
 
249 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  33.48 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  39.82 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  37.5 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.29 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.92 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>