More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0852 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  490  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  81.71 
 
 
245 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  79.27 
 
 
246 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  62.03 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  57.74 
 
 
262 aa  279  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  54.71 
 
 
311 aa  278  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  55.32 
 
 
259 aa  243  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
255 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  46.15 
 
 
252 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 
256 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 
256 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  45.6 
 
 
256 aa  224  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  44.9 
 
 
250 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 
257 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
259 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
260 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 
254 aa  192  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  37.14 
 
 
247 aa  190  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.78 
 
 
254 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
250 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
245 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
249 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  41.06 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  41.06 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  37.9 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.45 
 
 
249 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38 
 
 
250 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  41.22 
 
 
257 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.47 
 
 
257 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.18 
 
 
250 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
281 aa  175  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  40 
 
 
261 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  40 
 
 
261 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  43.75 
 
 
252 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  41.7 
 
 
250 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
250 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  38.14 
 
 
250 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.17 
 
 
262 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  41 
 
 
271 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  34.43 
 
 
249 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.65 
 
 
247 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.92 
 
 
258 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  37.14 
 
 
254 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
254 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.26 
 
 
268 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.51 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  39.44 
 
 
255 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  38.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
246 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  37.44 
 
 
221 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
248 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  38.49 
 
 
254 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.08 
 
 
251 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.44 
 
 
288 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  37.55 
 
 
266 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  41.18 
 
 
222 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  44.12 
 
 
251 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  42.72 
 
 
253 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
261 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  37.3 
 
 
262 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  40.72 
 
 
251 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  35.74 
 
 
255 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  38.33 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  38.33 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
249 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  40.81 
 
 
273 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  35.12 
 
 
273 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
255 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.23 
 
 
260 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.46 
 
 
259 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  39.04 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  44.9 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
284 aa  151  8e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  44.55 
 
 
253 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
284 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
247 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  34.76 
 
 
258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  37.5 
 
 
267 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
263 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  42.18 
 
 
286 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 
284 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  39.84 
 
 
287 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
296 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
249 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.5 
 
 
246 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>