More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0055 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  545  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  50 
 
 
271 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  49.13 
 
 
262 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  46.96 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  45.65 
 
 
263 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  45.22 
 
 
263 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  46.09 
 
 
246 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
249 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
249 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  44.78 
 
 
262 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  47.19 
 
 
252 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
236 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  45.41 
 
 
255 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
249 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
255 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  44.54 
 
 
266 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 
249 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
263 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 
249 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 
249 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  46.09 
 
 
259 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 
261 aa  205  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  44.78 
 
 
259 aa  205  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  45.22 
 
 
264 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  44.44 
 
 
246 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
247 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  43.78 
 
 
296 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  45.22 
 
 
260 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  43.78 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  44.44 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  46.96 
 
 
265 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
258 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  43.57 
 
 
257 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  42.61 
 
 
252 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  42.17 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  42.98 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  42.98 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  42.98 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  40.6 
 
 
249 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  44.87 
 
 
248 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
296 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  40.17 
 
 
298 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
259 aa  193  3e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  42.17 
 
 
252 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  41.48 
 
 
256 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
265 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 
265 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  40.09 
 
 
267 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  41.88 
 
 
243 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  40.43 
 
 
273 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
237 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.35 
 
 
258 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
248 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  40.95 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  40 
 
 
265 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.62 
 
 
271 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  39.51 
 
 
243 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  43.48 
 
 
286 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  41.53 
 
 
288 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  42.62 
 
 
248 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  42.02 
 
 
289 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  41.28 
 
 
248 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  38.86 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  40.43 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  40.77 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  40.42 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  42.55 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  40.43 
 
 
246 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  42.86 
 
 
298 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  40 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  42.08 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  41.1 
 
 
251 aa  178  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  42.67 
 
 
255 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  40.68 
 
 
255 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
265 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
265 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  42.62 
 
 
296 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  41.25 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  39.75 
 
 
249 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.68 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  41.07 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  44.09 
 
 
258 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0656  ABC transporter related  40 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0671  ABC transporter related  40 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000490679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  40.62 
 
 
311 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.58 
 
 
275 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  43.23 
 
 
297 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  42.58 
 
 
275 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.11 
 
 
275 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
252 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  43.23 
 
 
297 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  37.07 
 
 
299 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 
238 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  39.47 
 
 
274 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  39.06 
 
 
288 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>