More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0800 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  57.94 
 
 
240 aa  298  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  53.42 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  45.65 
 
 
249 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.44 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  38.79 
 
 
259 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  39.39 
 
 
251 aa  168  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
256 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
256 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  40.95 
 
 
258 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  40.26 
 
 
243 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  41.96 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  36.11 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  37.66 
 
 
258 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  39.53 
 
 
259 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  37.66 
 
 
258 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 
257 aa  161  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.29 
 
 
256 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
256 aa  161  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  39.27 
 
 
217 aa  160  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  39.34 
 
 
261 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  37.56 
 
 
244 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  39.17 
 
 
254 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.82 
 
 
254 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  39.91 
 
 
262 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  41.7 
 
 
265 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  39.05 
 
 
252 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
255 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.1 
 
 
243 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  37.1 
 
 
243 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  38.68 
 
 
254 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
254 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 
254 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.2 
 
 
261 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  37.85 
 
 
254 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  42.35 
 
 
257 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  38.86 
 
 
262 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.62 
 
 
250 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 
257 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  35.75 
 
 
243 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  42.05 
 
 
257 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  35.34 
 
 
250 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  39.39 
 
 
239 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  38.86 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  36.65 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  38.86 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  42.05 
 
 
257 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  38.6 
 
 
252 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 
255 aa  154  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
259 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  38.67 
 
 
258 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.07 
 
 
258 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  36.97 
 
 
252 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  38.57 
 
 
262 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  36.22 
 
 
266 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  41.03 
 
 
257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  39.25 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
254 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  36.61 
 
 
240 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  34.16 
 
 
262 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  37.74 
 
 
251 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.5 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  151  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  38.14 
 
 
251 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
276 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  36.71 
 
 
252 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  38.14 
 
 
251 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.19 
 
 
249 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  37.79 
 
 
252 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  34.31 
 
 
254 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  33.98 
 
 
257 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
245 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  36.97 
 
 
251 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  35.22 
 
 
243 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  38.33 
 
 
246 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  36.97 
 
 
251 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  33.48 
 
 
256 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  34.39 
 
 
249 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  36.97 
 
 
251 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  38.71 
 
 
301 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  36.97 
 
 
251 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.84 
 
 
231 aa  148  8e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>