More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1936 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  100 
 
 
287 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  60.45 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  54.2 
 
 
253 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  56.47 
 
 
286 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  55.68 
 
 
262 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  57.53 
 
 
247 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  59.01 
 
 
253 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  49.21 
 
 
277 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  54.19 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  53.09 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  59.02 
 
 
279 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  48.65 
 
 
259 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  52.44 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
261 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  42.01 
 
 
252 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.43 
 
 
244 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.41 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.44 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
256 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  37.85 
 
 
257 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
255 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.81 
 
 
250 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  42.27 
 
 
262 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
255 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  38.93 
 
 
249 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
261 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 
260 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.39 
 
 
264 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  38.67 
 
 
311 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.21 
 
 
257 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
255 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  41.22 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.71 
 
 
247 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  39.18 
 
 
250 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
245 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36.87 
 
 
254 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  38.02 
 
 
259 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  30.17 
 
 
246 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
259 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  41.63 
 
 
250 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 
243 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
258 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  44.5 
 
 
222 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
249 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.74 
 
 
251 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.3 
 
 
228 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  43.84 
 
 
259 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
247 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.98 
 
 
256 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  38.18 
 
 
262 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  38.43 
 
 
262 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  40.09 
 
 
248 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.66 
 
 
251 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  39.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  34.4 
 
 
249 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  38.61 
 
 
261 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  38.61 
 
 
261 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
250 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  39.19 
 
 
251 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.19 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.26 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  42.11 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  31.51 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
245 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  40.61 
 
 
278 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.64 
 
 
262 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
254 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  30.71 
 
 
280 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
246 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40 
 
 
263 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.17 
 
 
268 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  41.51 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.49 
 
 
251 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  40.48 
 
 
252 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  35.62 
 
 
263 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  37.02 
 
 
250 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 
249 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.04 
 
 
271 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  39.84 
 
 
246 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  40.87 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
266 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  39.73 
 
 
247 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
255 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  32.72 
 
 
221 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  39.47 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.73 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>