More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2646 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
256 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
256 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  51.63 
 
 
256 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
256 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
256 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.63 
 
 
256 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 
256 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
256 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 
256 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
256 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  51.63 
 
 
252 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 
257 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  48.74 
 
 
259 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  44.13 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  45.37 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  39.73 
 
 
254 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  43.52 
 
 
255 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  39.57 
 
 
254 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
245 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  39.74 
 
 
262 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
250 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  41.13 
 
 
250 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  40.09 
 
 
249 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
243 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  41.45 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  41.45 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
249 aa  178  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
246 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  40.91 
 
 
250 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  41.05 
 
 
257 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 
245 aa  176  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  40.18 
 
 
250 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
236 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  39.44 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  40.09 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  42.99 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  37.85 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
254 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
254 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.76 
 
 
249 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  40.47 
 
 
246 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  41.59 
 
 
250 aa  168  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  42.13 
 
 
258 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.05 
 
 
251 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  38.64 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
259 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  36.29 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  36.29 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  41.67 
 
 
251 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  39.74 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  42.93 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  39.11 
 
 
252 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  39.45 
 
 
244 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
236 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  38.68 
 
 
221 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  38.29 
 
 
247 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.51 
 
 
251 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.48 
 
 
259 aa  158  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
247 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  39.73 
 
 
262 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.89 
 
 
251 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  38.21 
 
 
287 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.41 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
263 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  39.52 
 
 
222 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.96 
 
 
263 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
230 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
281 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
221 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  37.44 
 
 
259 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 
255 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  39.34 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 
243 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  37.96 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
249 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  35.81 
 
 
257 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
254 aa  151  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.84 
 
 
236 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
261 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
261 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.01 
 
 
250 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.02 
 
 
265 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.6 
 
 
268 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.14 
 
 
258 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
253 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  38.54 
 
 
223 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>