More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3438 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  90.91 
 
 		 253 aa  427  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  63.11 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 262 aa  275  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  59 
 
 		 277 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  54.2 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  56.54 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  53.36 
 
 		 286 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  54.1 
 
 		 276 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  50.63 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.03 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  51.29 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.03 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.82 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  37.85 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35.22 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.8 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.09 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  45.74 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.43 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  44.84 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  48.74 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  41.78 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.38 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  41.49 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  31.15 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  34.25 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  44.15 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  39.5 
 
 		 273 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.1 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  40.25 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  41.82 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  37.22 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  37.22 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  39.09 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  40.3 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.27 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  43.27 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  39 
 
 		 265 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  39.91 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.83 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  42.56 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36.7 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.11 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40.83 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.94 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  37.6 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.43 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.67 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  37.75 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.86 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  37.75 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1097  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.909565  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.01 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  41.4 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  45.07 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.91 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  36.36 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  38.8 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  32 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.61 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  38.71 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.56 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.49 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>