More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1534 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  60.42 
 
 		 276 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  53.11 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  50.63 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  51.04 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  53.68 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  47.9 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  48.65 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  45.91 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  48.2 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  38.77 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.48 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.09 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  36.84 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  33.78 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.55 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  35.84 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.04 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.45 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  36.22 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  36.49 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  33.93 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  36.28 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  36.28 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.32 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  37 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.91 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  29.88 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  32.64 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  37.67 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.31 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  36.92 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  37.55 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  36.89 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  37.16 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  30.77 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  39.81 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  35.87 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  33.63 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  36.2 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  35.48 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  35.27 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.13 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.08 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  31.74 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  34.05 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  36.4 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  37.66 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  33.05 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  34.63 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  35.02 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  35.02 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  34.7 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  34.36 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  34.01 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.89 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  36.04 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>