More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1726 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  67.58 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2209  ATPase  54.14 
 
 		 271 aa  251  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.412133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  47.91 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  53.75 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  44.98 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  43.1 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  41.74 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  41.74 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.43 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  46.54 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  44.44 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  45.41 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  43.2 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  46.15 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  45.37 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  40 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  36.51 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  39.18 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  39.67 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.86 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  45.02 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  43.3 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  41.55 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.65 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  36.73 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.7 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  34.1 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  34.1 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.88 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  40.25 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.35 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.1 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.36 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.67 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.93 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  40.67 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.69 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  36.95 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.51 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  37.62 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.07 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  35.16 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.91 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  36.82 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4740  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  41.9 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  41.58 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  41.58 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.94 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  41.58 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.07 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  38.68 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  34.63 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  37.98 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>