More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1317 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  100 
 
 
245 aa  493  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  48.75 
 
 
252 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  50.63 
 
 
248 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  48.71 
 
 
251 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  47.62 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  47.19 
 
 
252 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
247 aa  211  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  45.69 
 
 
258 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  44.4 
 
 
252 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  45.26 
 
 
273 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  45.26 
 
 
246 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  44.83 
 
 
246 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  45.45 
 
 
262 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  44.59 
 
 
271 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  43.97 
 
 
265 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  42.24 
 
 
255 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  42.67 
 
 
263 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  43.53 
 
 
249 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
237 aa  198  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
255 aa  198  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  46.12 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  44.64 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  42.67 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
236 aa  195  7e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  44.4 
 
 
248 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  42.62 
 
 
255 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  39.09 
 
 
266 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  42.67 
 
 
268 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  40.53 
 
 
249 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 
265 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
265 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  39.41 
 
 
243 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  41.77 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  40.43 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  42.24 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 
249 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  43.04 
 
 
278 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  40.43 
 
 
286 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  43.35 
 
 
247 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
249 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  39.59 
 
 
257 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.22 
 
 
246 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  36.48 
 
 
280 aa  180  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.66 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.87 
 
 
258 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  46.3 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
249 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  39.91 
 
 
289 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  38.46 
 
 
298 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.65 
 
 
236 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  41.92 
 
 
258 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.34 
 
 
271 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.77 
 
 
256 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
254 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.09 
 
 
262 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
259 aa  175  6e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  38.03 
 
 
292 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  38.46 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  38.46 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  38.89 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  38.46 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.95 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.03 
 
 
251 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.96 
 
 
247 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  38.46 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 
261 aa  171  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36.75 
 
 
288 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
238 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  38.98 
 
 
249 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  41.81 
 
 
250 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  37.23 
 
 
299 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  38.26 
 
 
275 aa  168  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  36.52 
 
 
274 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  37.39 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  37.39 
 
 
275 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.64 
 
 
273 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  37.39 
 
 
275 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.26 
 
 
258 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.64 
 
 
273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.64 
 
 
273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  39.57 
 
 
260 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.64 
 
 
273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.26 
 
 
258 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.64 
 
 
273 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
252 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  36.75 
 
 
311 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>