More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3403 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  69.96 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  68.61 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  68.23 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  65.07 
 
 		 298 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  66.55 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  66.55 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  66.55 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  64.93 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  65.16 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  64.87 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  64.87 
 
 		 296 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  67.65 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  64.66 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  63.14 
 
 		 298 aa  352  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  63.21 
 
 		 299 aa  351  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  63.19 
 
 		 300 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  62.63 
 
 		 275 aa  348  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  63.96 
 
 		 297 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  63.96 
 
 		 297 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  63.43 
 
 		 275 aa  344  8.999999999999999e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  60.93 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  62.22 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  61.85 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  61.85 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  61.85 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  61.85 
 
 		 273 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  335  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  64.32 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  60 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  48.16 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  53.62 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  55.28 
 
 		 255 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  55.06 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  51.81 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  53.56 
 
 		 249 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  50.85 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  52.56 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.99 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  51.49 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 248 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  48.1 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  45.53 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 254 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  44.62 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  45.99 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  45.93 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  43.15 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  45.76 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  46.15 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  46.25 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  44.03 
 
 		 251 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  44.8 
 
 		 268 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 249 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  45.26 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  43.33 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  43.97 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  44.96 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  42.49 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  41.53 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  43.35 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 261 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  39.22 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  43.35 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  44.72 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  44.92 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  44.58 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  45.11 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  38.78 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  42.92 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  42.39 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 249 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  45.06 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  39 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  42.19 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  42.26 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>