More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0501 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  45.45 
 
 
221 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  41.62 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.93 
 
 
256 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
256 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  41.12 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 
257 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
249 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 
250 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
249 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 
256 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  40.61 
 
 
252 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
249 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  35.15 
 
 
284 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.54 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
249 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
257 aa  148  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
249 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  40 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
255 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
254 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.91 
 
 
276 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  35.75 
 
 
254 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  35.71 
 
 
250 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  36.73 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  34.31 
 
 
250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  34.48 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  36.87 
 
 
286 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  35.44 
 
 
239 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.56 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  36.59 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 
255 aa  138  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  36.84 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.82 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  33.5 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  36.55 
 
 
249 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.65 
 
 
259 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.15 
 
 
268 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  37.81 
 
 
254 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  34.5 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  34.5 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
236 aa  135  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.18 
 
 
248 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  34.98 
 
 
251 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  38.31 
 
 
236 aa  134  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  36.63 
 
 
246 aa  134  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.58 
 
 
257 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  34.48 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  38.07 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  35.12 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
254 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
254 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  36.55 
 
 
249 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  32.51 
 
 
262 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
250 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  31.68 
 
 
248 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
260 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  32.5 
 
 
258 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  33.83 
 
 
250 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  39.3 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  37.62 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  32.14 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  34.65 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
254 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  36.36 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  37.5 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 
249 aa  128  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  35 
 
 
279 aa  128  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  32.84 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  38.5 
 
 
258 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  33.82 
 
 
262 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.21 
 
 
260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  37.62 
 
 
268 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.04 
 
 
248 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  30.35 
 
 
258 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
245 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.85 
 
 
271 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
261 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  33.5 
 
 
264 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  33.33 
 
 
267 aa  124  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>