More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1057 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.92 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04300  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.98 
 
 		 234 aa  178  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.46 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.67 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  41.51 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.5 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.19 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  35.15 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.8 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  38.42 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 250 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  38.08 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  36.62 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  36.74 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  38.21 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  37.6 
 
 		 253 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  40 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  33.65 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  41.35 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  39.9 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  38.28 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  35.89 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  35.95 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.63 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  30.29 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  37.97 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.4 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  37.73 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.89 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.02 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.42 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  36.57 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  37.32 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  32.5 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  38.83 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  35.74 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  41.41 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  36 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.29 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.6 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.62 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.33 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  32.86 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.68 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  35.56 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  32.86 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  32.86 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  36.06 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  37 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  31.03 
 
 		 220 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  35.78 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.34 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.45 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.83 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.38 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  33.5 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.83 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  36.36 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  33.98 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  34.13 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>