More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0858 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  63.98 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  61.29 
 
 
262 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
259 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  56.54 
 
 
253 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  58.65 
 
 
253 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  54.19 
 
 
287 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  58.99 
 
 
247 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  54.43 
 
 
276 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  51.87 
 
 
286 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  51.93 
 
 
279 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
261 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  45.91 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
256 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.26 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.88 
 
 
244 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
260 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  45.06 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.65 
 
 
257 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 
257 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
258 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.95 
 
 
256 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
256 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  40.2 
 
 
264 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  37.74 
 
 
254 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
255 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
261 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  43.65 
 
 
255 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40.65 
 
 
259 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  44 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  38.74 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.83 
 
 
273 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  38 
 
 
261 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  38 
 
 
261 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
262 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  43.38 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.92 
 
 
256 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.28 
 
 
250 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  41.78 
 
 
278 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  39.44 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  37.61 
 
 
250 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  41.88 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  41.89 
 
 
250 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.89 
 
 
265 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  40.84 
 
 
263 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  38.26 
 
 
251 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  39.04 
 
 
286 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
249 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.72 
 
 
258 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.18 
 
 
262 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
249 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  39.46 
 
 
251 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.83 
 
 
251 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  42.71 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  36.65 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 
249 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 
249 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  39.25 
 
 
251 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
245 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.69 
 
 
271 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
263 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  41.98 
 
 
247 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  38.6 
 
 
266 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.62 
 
 
246 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  36.36 
 
 
250 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  44.29 
 
 
228 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.81 
 
 
236 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  37.2 
 
 
252 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  37.86 
 
 
248 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  37.04 
 
 
252 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
250 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  38.36 
 
 
248 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  36.36 
 
 
252 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  39.81 
 
 
263 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
259 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  39.19 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  35.48 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  37.76 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.28 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
250 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  41.28 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>