More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  100 
 
 
228 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  46.3 
 
 
287 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  48 
 
 
286 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  44.2 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  44.29 
 
 
264 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  45.09 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.85 
 
 
257 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
258 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
262 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
259 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.32 
 
 
251 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
255 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.47 
 
 
244 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  39.55 
 
 
262 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 
257 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
256 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
256 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.42 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  39.42 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  32.7 
 
 
266 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.59 
 
 
262 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  34.42 
 
 
256 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
255 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  37.86 
 
 
259 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  32.99 
 
 
236 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.07 
 
 
263 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.07 
 
 
252 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  35.92 
 
 
263 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  40.61 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  39 
 
 
255 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
247 aa  134  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  43.26 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.75 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  35.27 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.88 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  38.69 
 
 
255 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  36.32 
 
 
248 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  38.07 
 
 
275 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  35.75 
 
 
275 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  38 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  39.8 
 
 
258 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  37 
 
 
299 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
249 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  35.27 
 
 
247 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.5 
 
 
258 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  35.95 
 
 
311 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.79 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  39.49 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.04 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  43.96 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.58 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.58 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.58 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  31.8 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.78 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  33.67 
 
 
264 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  35.81 
 
 
273 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
256 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  35.61 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.11 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  36.71 
 
 
296 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  34.47 
 
 
298 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  41.87 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  39.39 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  41.84 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.03 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 
260 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  33.78 
 
 
239 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  35.47 
 
 
296 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
296 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  42.21 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  42.21 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
243 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  46.99 
 
 
257 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  33.71 
 
 
277 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.49 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
254 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 
254 aa  124  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>