More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2418 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  67.66 
 
 
236 aa  354  8.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  69.78 
 
 
235 aa  346  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.62 
 
 
257 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
256 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
256 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
256 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
256 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  41.59 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
236 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  39.65 
 
 
254 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.65 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
256 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
260 aa  168  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
257 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.43 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  37.62 
 
 
249 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.61 
 
 
250 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
255 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  41 
 
 
259 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
247 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.1 
 
 
247 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
255 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
255 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.15 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  40.09 
 
 
239 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
230 aa  151  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.44 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.65 
 
 
256 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  38.1 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  38.1 
 
 
236 aa  148  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  34.27 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  37.56 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.56 
 
 
251 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.82 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.23 
 
 
249 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  35.56 
 
 
261 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  35.56 
 
 
261 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  33.81 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
250 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36 
 
 
247 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.95 
 
 
263 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.92 
 
 
246 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
246 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  37.44 
 
 
247 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  35.51 
 
 
221 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
249 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  36.22 
 
 
250 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.89 
 
 
263 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.89 
 
 
263 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  37.14 
 
 
250 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 
260 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
250 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
254 aa  141  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
255 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
250 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  37.67 
 
 
220 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  34.93 
 
 
254 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  39.25 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  39.06 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.44 
 
 
262 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  35.29 
 
 
249 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
256 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.26 
 
 
258 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  35.78 
 
 
265 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  36.6 
 
 
258 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  35.38 
 
 
255 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
262 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  36.6 
 
 
258 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  35.96 
 
 
247 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.14 
 
 
262 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
284 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
284 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.27 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  38.32 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.68 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  38.46 
 
 
266 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  35.1 
 
 
248 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
278 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
284 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.97 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  36.49 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.44 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
274 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  36.57 
 
 
221 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  35.29 
 
 
249 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>