More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3281 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  44.75 
 
 
280 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
260 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  42.91 
 
 
275 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  44.31 
 
 
278 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  43.92 
 
 
261 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.23 
 
 
263 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
261 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
261 aa  214  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  43.97 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  42.75 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  43.43 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  41.25 
 
 
280 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  42.41 
 
 
273 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
271 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
284 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 
278 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  42.02 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  42.02 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  42.02 
 
 
290 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  42.91 
 
 
291 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.11 
 
 
272 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.25 
 
 
264 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  41.06 
 
 
273 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  42.06 
 
 
287 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  38.4 
 
 
270 aa  201  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
266 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.65 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  41.41 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  42.13 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  39.77 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.52 
 
 
274 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  40.94 
 
 
306 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
261 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  40.78 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.46 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  43.19 
 
 
286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  38.37 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  42.55 
 
 
276 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
260 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
272 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  38.89 
 
 
260 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  38.89 
 
 
260 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  38.27 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
277 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  38.76 
 
 
264 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  38.61 
 
 
259 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  38.61 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  38.61 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 
264 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
265 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  36.13 
 
 
282 aa  169  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 
263 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
266 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  39.84 
 
 
283 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.11 
 
 
264 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  35.04 
 
 
272 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  36.47 
 
 
262 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 
275 aa  141  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
267 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  34.04 
 
 
253 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  34.11 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  33.19 
 
 
253 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  32.05 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  33.2 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.52 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 
269 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  28.97 
 
 
262 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  28.12 
 
 
262 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  32.03 
 
 
271 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 
290 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  30.83 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  35.25 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.2 
 
 
262 aa  131  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.13 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 
276 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.47 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  28.17 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  32.93 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  33.82 
 
 
223 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.33 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  32.42 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  31.4 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 
256 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  34.21 
 
 
636 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  28.63 
 
 
268 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  33.97 
 
 
424 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
485 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
263 aa  122  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  31.95 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.92 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  29.83 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.6 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
246 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  33.49 
 
 
489 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>