More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0753 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  100 
 
 
636 aa  1258    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  43.66 
 
 
562 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  40.61 
 
 
514 aa  294  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  36.85 
 
 
501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  30.04 
 
 
494 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  31.69 
 
 
497 aa  194  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  30.12 
 
 
498 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  30.12 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  29.71 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.72 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.7 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  29.88 
 
 
498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.94 
 
 
491 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.15 
 
 
491 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.15 
 
 
491 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.59 
 
 
490 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.39 
 
 
490 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.98 
 
 
490 aa  160  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.98 
 
 
490 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  27.67 
 
 
497 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.98 
 
 
490 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  29.98 
 
 
490 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.69 
 
 
491 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.98 
 
 
490 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 
484 aa  157  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  28.43 
 
 
496 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.27 
 
 
491 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.73 
 
 
490 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
485 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.73 
 
 
490 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  28.29 
 
 
495 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  38.89 
 
 
489 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  28.78 
 
 
470 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  28.29 
 
 
495 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  45.05 
 
 
479 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  29.74 
 
 
492 aa  150  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  45.65 
 
 
478 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.57 
 
 
488 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.08 
 
 
274 aa  140  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  35.53 
 
 
275 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  28.54 
 
 
500 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.96 
 
 
265 aa  139  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  36.52 
 
 
271 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.52 
 
 
500 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
260 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 
275 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
267 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.53 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  35.84 
 
 
271 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.53 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.53 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  26.33 
 
 
459 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.78 
 
 
260 aa  134  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.78 
 
 
260 aa  134  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.36 
 
 
263 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  35.81 
 
 
280 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 
261 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  30.39 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  31.94 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.79 
 
 
269 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  39.56 
 
 
263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  35.81 
 
 
262 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  28.15 
 
 
491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  35.44 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 
269 aa  127  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  39.57 
 
 
268 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.47 
 
 
260 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
261 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  32.43 
 
 
475 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.07 
 
 
270 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  33.62 
 
 
258 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  35.68 
 
 
272 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  24.52 
 
 
497 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
286 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  34.21 
 
 
262 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  26.97 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
266 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 
262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  38.7 
 
 
286 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  27.41 
 
 
474 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 
264 aa  120  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  31.86 
 
 
259 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  35.56 
 
 
620 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  36.03 
 
 
287 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.78 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  36.52 
 
 
274 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
264 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 
260 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  34.35 
 
 
336 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  37.12 
 
 
264 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  35.09 
 
 
264 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  33.19 
 
 
248 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 
260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  34.06 
 
 
263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.67 
 
 
246 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  35 
 
 
280 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  31.25 
 
 
499 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>