More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1927 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  100 
 
 		 474 aa  951    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  32.56 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  32.09 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  28.91 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.08 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  25.36 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  31.93 
 
 		 479 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  30.02 
 
 		 562 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  26.8 
 
 		 482 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  29.72 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  26.69 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.48 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.95 
 
 		 535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.27 
 
 		 491 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  32.56 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.51 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  27.41 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.17 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.77 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  26.77 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.77 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.57 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.57 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  25.21 
 
 		 497 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  25.15 
 
 		 495 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  28 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  27.51 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  26.69 
 
 		 842 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  26.43 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4323  ABC transporter related protein  26.78 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  34.53 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.42 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.45 
 
 		 914 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  24.85 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  28.57 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 		 264 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.08 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 354 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  27.52 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  26.38 
 
 		 582 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  24.45 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  27.51 
 
 		 859 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  25.45 
 
 		 516 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  29.62 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1042  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  27.69 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  32.84 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  33.47 
 
 		 264 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  25.5 
 
 		 509 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  22.61 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0700  ABC transporter related  24.44 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000766615  hitchhiker  0.000015345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  22.61 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  29.7 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  25 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  24.42 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  27.18 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  24.56 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  35.47 
 
 		 338 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  30.15 
 
 		 538 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  27.1 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  32.77 
 
 		 250 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  27.53 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 		 346 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  29.26 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  26.8 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  26.8 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  31.63 
 
 		 349 aa  94  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  31.73 
 
 		 350 aa  93.6  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.44 
 
 		 357 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  36.36 
 
 		 308 aa  93.6  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  26.94 
 
 		 367 aa  93.6  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  34.98 
 
 		 342 aa  93.2  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.71 
 
 		 345 aa  93.2  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.51 
 
 		 353 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  26.75 
 
 		 550 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  33.82 
 
 		 338 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  25.9 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  24.5 
 
 		 935 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  26.56 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  28.44 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.65 
 
 		 216 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.02 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  25.97 
 
 		 254 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  25.64 
 
 		 916 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  25.93 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.98 
 
 		 359 aa  91.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.05 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  29.03 
 
 		 236 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  24.82 
 
 		 557 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 260 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  25.64 
 
 		 906 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  30.6 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  30.6 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  32.27 
 
 		 349 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>