More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1986 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  100 
 
 
501 aa  1010    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  39.45 
 
 
562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  37.48 
 
 
514 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.85 
 
 
636 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
494 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  37.3 
 
 
479 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
478 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  34.54 
 
 
483 aa  219  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  37.57 
 
 
479 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  34.24 
 
 
497 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  33.2 
 
 
489 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  31.34 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.82 
 
 
500 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.43 
 
 
490 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.01 
 
 
490 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  27.52 
 
 
491 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.56 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.56 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.34 
 
 
496 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
485 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  26.87 
 
 
475 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.33 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.15 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.15 
 
 
491 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.01 
 
 
491 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.99 
 
 
490 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.01 
 
 
491 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
490 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.15 
 
 
491 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.56 
 
 
490 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.74 
 
 
491 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.6 
 
 
491 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.99 
 
 
490 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.37 
 
 
488 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.79 
 
 
490 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.6 
 
 
490 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.47 
 
 
489 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  29.08 
 
 
474 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  25.4 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  26.86 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  27.33 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 
501 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  40 
 
 
620 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  29.31 
 
 
489 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  28.12 
 
 
495 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  27.69 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  26.97 
 
 
496 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  27.14 
 
 
498 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  27.69 
 
 
498 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  26.92 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  27.29 
 
 
498 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  27.27 
 
 
498 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  26.32 
 
 
459 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  25.05 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  26.07 
 
 
492 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  24.25 
 
 
413 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  26.58 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.35 
 
 
263 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  26.67 
 
 
539 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
267 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  33.05 
 
 
336 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 
260 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  32.91 
 
 
271 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  30.67 
 
 
272 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  25.33 
 
 
544 aa  104  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
260 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.57 
 
 
535 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  26.48 
 
 
493 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.23 
 
 
266 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 
264 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 
255 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  34.78 
 
 
262 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2738  ABC transporter related protein  27.09 
 
 
520 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.2 
 
 
269 aa  100  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  23.08 
 
 
498 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  29.83 
 
 
254 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  27.54 
 
 
538 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  24.43 
 
 
507 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  28.95 
 
 
263 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  30.9 
 
 
269 aa  100  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  31.17 
 
 
265 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  32.78 
 
 
283 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  23.64 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  23.79 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  27.5 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  28.28 
 
 
540 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.43 
 
 
260 aa  99  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  29.82 
 
 
260 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  29.82 
 
 
260 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  26.68 
 
 
469 aa  99.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  25.38 
 
 
519 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  28.64 
 
 
261 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  26.69 
 
 
914 aa  97.8  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  26.05 
 
 
519 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  24.56 
 
 
519 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  26.05 
 
 
519 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  24.85 
 
 
555 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  28.64 
 
 
261 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>