More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0686 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  84.25 
 
 
470 aa  787    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  85.16 
 
 
498 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  85.16 
 
 
498 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  80.17 
 
 
495 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  79.96 
 
 
495 aa  797    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  100 
 
 
492 aa  995    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  79.79 
 
 
496 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  85.37 
 
 
498 aa  848    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  84.96 
 
 
498 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  54.11 
 
 
484 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  52.02 
 
 
489 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  41.34 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.04 
 
 
488 aa  332  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.37 
 
 
491 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.67 
 
 
490 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.17 
 
 
491 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.17 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.17 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.96 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.17 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.75 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  38.22 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.77 
 
 
489 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.66 
 
 
496 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.75 
 
 
490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  36.97 
 
 
489 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.38 
 
 
497 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.25 
 
 
496 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.13 
 
 
490 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.13 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.91 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.7 
 
 
490 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.99 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.7 
 
 
490 aa  312  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  39.62 
 
 
491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  71.2 
 
 
198 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  36.29 
 
 
459 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  33.84 
 
 
497 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  35.78 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  35.04 
 
 
499 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  31.54 
 
 
497 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  34.54 
 
 
500 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  33.62 
 
 
413 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  31.75 
 
 
482 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  28.6 
 
 
514 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 
501 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  28.3 
 
 
494 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  26.61 
 
 
562 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  29.74 
 
 
636 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  31.93 
 
 
479 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  28.65 
 
 
541 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  32.21 
 
 
478 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  32.97 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  27.07 
 
 
635 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  28.71 
 
 
756 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  30.81 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.49 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  37.5 
 
 
280 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
275 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  34.52 
 
 
262 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  28.19 
 
 
500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.76 
 
 
269 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  32.41 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  30.27 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  29.82 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  25.94 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  33.04 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.78 
 
 
265 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  27.8 
 
 
275 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  32.17 
 
 
260 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  32.17 
 
 
260 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.72 
 
 
274 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  32.02 
 
 
273 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.18 
 
 
770 aa  104  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  31.02 
 
 
270 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 
267 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 
263 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  30.84 
 
 
291 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.63 
 
 
260 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  32.13 
 
 
266 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  26.26 
 
 
912 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  31.4 
 
 
276 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  32.18 
 
 
257 aa  100  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  30.56 
 
 
265 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.16 
 
 
270 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
271 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.85 
 
 
263 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.77 
 
 
269 aa  99.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  29.91 
 
 
271 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.91 
 
 
260 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  25.98 
 
 
912 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
256 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  27.7 
 
 
258 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  32.13 
 
 
264 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  29.73 
 
 
336 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  25.98 
 
 
912 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>