More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1415 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  75 
 
 
490 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  75.21 
 
 
490 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.4 
 
 
490 aa  732    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  99.19 
 
 
496 aa  1004    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  72.75 
 
 
489 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.97 
 
 
491 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.79 
 
 
490 aa  757    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.8 
 
 
490 aa  762    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.79 
 
 
490 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  75.26 
 
 
491 aa  755    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  78.64 
 
 
490 aa  786    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.79 
 
 
490 aa  756    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.97 
 
 
491 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  100 
 
 
497 aa  1013    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.23 
 
 
491 aa  742    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  75 
 
 
490 aa  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  72.13 
 
 
488 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.97 
 
 
491 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  99.8 
 
 
496 aa  1008    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.76 
 
 
491 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.76 
 
 
491 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  44.25 
 
 
497 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  44.77 
 
 
475 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  43.04 
 
 
489 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 
484 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  42.04 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  39.96 
 
 
498 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  39.55 
 
 
498 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  39.96 
 
 
498 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  39.71 
 
 
498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  43.34 
 
 
489 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  38.25 
 
 
495 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  40.38 
 
 
492 aa  300  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
470 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  38.05 
 
 
495 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  38.76 
 
 
496 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  37.66 
 
 
497 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  39.42 
 
 
459 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  36 
 
 
499 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  36.92 
 
 
459 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
482 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  38.44 
 
 
413 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  33.96 
 
 
500 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  32.33 
 
 
497 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
501 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  55.74 
 
 
198 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  33.47 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  30.37 
 
 
494 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 
479 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 
478 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  28.55 
 
 
562 aa  170  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  27.84 
 
 
514 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  30.23 
 
 
541 aa  161  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  30.04 
 
 
483 aa  157  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  31.56 
 
 
501 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  27.78 
 
 
500 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.53 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  39.61 
 
 
260 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  30.34 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  27.62 
 
 
635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  37.44 
 
 
260 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  37.44 
 
 
260 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  33.33 
 
 
275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  25.88 
 
 
510 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  26.63 
 
 
536 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  39.34 
 
 
280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  25.65 
 
 
628 aa  117  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.63 
 
 
263 aa  117  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.42 
 
 
914 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  27.47 
 
 
912 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  23.99 
 
 
512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  26.86 
 
 
920 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  26.18 
 
 
514 aa  113  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  25.93 
 
 
919 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  39.34 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  25.1 
 
 
935 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  25.59 
 
 
926 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  26.36 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  25.91 
 
 
901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
266 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.65 
 
 
916 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 
269 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 
770 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  25.91 
 
 
901 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  32.62 
 
 
275 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25.77 
 
 
922 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  26.54 
 
 
936 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  26.54 
 
 
936 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  25.96 
 
 
526 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  25.58 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  26.88 
 
 
756 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.39 
 
 
906 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.76 
 
 
272 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  25.16 
 
 
922 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  25.11 
 
 
927 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  27.31 
 
 
502 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  25.97 
 
 
810 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>