More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2046 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  100 
 
 		 491 aa  999    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  52.64 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.78 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.53 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.11 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.32 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.53 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.11 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.06 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.26 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.26 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.47 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  42.55 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.47 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.86 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.58 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.12 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.3 
 
 		 490 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.37 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.81 
 
 		 496 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.64 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.04 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.81 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  38.25 
 
 		 489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  40.63 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  39.29 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  40.26 
 
 		 495 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  39.75 
 
 		 495 aa  329  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  39.61 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  38.88 
 
 		 498 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  39.09 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  39.52 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  39.09 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  39.26 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  39.35 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  38.18 
 
 		 489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  39.62 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  30.8 
 
 		 499 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  33.27 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  37.61 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  31.92 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  55.08 
 
 		 198 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  26.11 
 
 		 514 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  26.95 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  27.52 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  27.63 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  28.83 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  26.68 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  25.25 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  28.11 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  28.15 
 
 		 636 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  26.53 
 
 		 541 aa  126  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  25.15 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.47 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  33.65 
 
 		 260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  33.65 
 
 		 260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  28.61 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  31.36 
 
 		 275 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  25.51 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.42 
 
 		 263 aa  114  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  31.84 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 		 263 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  29.82 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.34 
 
 		 260 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  27.93 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  29.09 
 
 		 273 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  33.95 
 
 		 259 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  33.95 
 
 		 259 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  27.27 
 
 		 275 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  30.32 
 
 		 286 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  30.7 
 
 		 303 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  33.49 
 
 		 259 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  28.81 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 266 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  23.18 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.61 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  24.64 
 
 		 932 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  26.19 
 
 		 272 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  27.48 
 
 		 261 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.52 
 
 		 269 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 272 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 256 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.43 
 
 		 262 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.49 
 
 		 263 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  23.65 
 
 		 928 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  24.8 
 
 		 906 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  24.68 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  24.68 
 
 		 906 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  27.59 
 
 		 278 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  30.94 
 
 		 270 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 265 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>