More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5340 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  73.08 
 
 
261 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  66.02 
 
 
264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  63.85 
 
 
261 aa  317  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  63.95 
 
 
273 aa  315  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  63.36 
 
 
262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  63.67 
 
 
261 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  62.98 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  64.37 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  62.5 
 
 
261 aa  304  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  62.89 
 
 
272 aa  304  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  64.45 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  64.45 
 
 
303 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  64.98 
 
 
268 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  62.89 
 
 
286 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  63.28 
 
 
278 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.57 
 
 
270 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  62.26 
 
 
265 aa  294  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  60.16 
 
 
274 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  62.75 
 
 
264 aa  292  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  60.24 
 
 
263 aa  289  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  59.61 
 
 
273 aa  288  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  60.31 
 
 
271 aa  285  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  59.92 
 
 
286 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  56.03 
 
 
270 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  55.21 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  54.09 
 
 
280 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  53.25 
 
 
278 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  54.3 
 
 
306 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  52.61 
 
 
290 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  52.61 
 
 
290 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  52.61 
 
 
290 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  54.47 
 
 
287 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
284 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  50 
 
 
271 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
277 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.78 
 
 
282 aa  202  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  41.11 
 
 
262 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 
264 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  43.85 
 
 
259 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  44.23 
 
 
259 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  43.85 
 
 
259 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  39.69 
 
 
275 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  42.02 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  41.73 
 
 
280 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
265 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  38.04 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  41.2 
 
 
275 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.9 
 
 
263 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  37.92 
 
 
260 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  37.92 
 
 
260 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
270 aa  165  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.07 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.54 
 
 
264 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  36.69 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  34.94 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
261 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.93 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  28.57 
 
 
270 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  33.59 
 
 
272 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  27.31 
 
 
262 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  37.18 
 
 
636 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
263 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  27.27 
 
 
270 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.56 
 
 
265 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  23.23 
 
 
262 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.38 
 
 
269 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
266 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.2 
 
 
262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  23.51 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  26.67 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  35.98 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.91 
 
 
488 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  37.94 
 
 
279 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  28.89 
 
 
500 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  30.16 
 
 
271 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
490 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  37.25 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.4 
 
 
490 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.4 
 
 
490 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  43.48 
 
 
479 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.4 
 
 
490 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.4 
 
 
490 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  36.54 
 
 
283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  28.52 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.94 
 
 
490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.94 
 
 
490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  31.89 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.93 
 
 
490 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  31.62 
 
 
269 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.07 
 
 
494 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  36.67 
 
 
273 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  34.69 
 
 
254 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>