More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0941 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  100 
 
 
562 aa  1111    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  43.66 
 
 
636 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  45.7 
 
 
514 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  39.45 
 
 
501 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
494 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  40.15 
 
 
478 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  38.2 
 
 
479 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 
479 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  32.84 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  27.62 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  29.85 
 
 
497 aa  183  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  29.37 
 
 
489 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  29.62 
 
 
500 aa  177  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.68 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.13 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.86 
 
 
497 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.34 
 
 
496 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.73 
 
 
496 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.54 
 
 
500 aa  170  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.96 
 
 
491 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.03 
 
 
491 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.03 
 
 
491 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.1 
 
 
491 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.03 
 
 
491 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.56 
 
 
490 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.38 
 
 
490 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.73 
 
 
491 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.57 
 
 
488 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.39 
 
 
490 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  27.39 
 
 
490 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.39 
 
 
490 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.18 
 
 
490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  31.04 
 
 
485 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.2 
 
 
490 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.2 
 
 
490 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  27.59 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.35 
 
 
489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  30.02 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  25.74 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  29 
 
 
498 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  26.41 
 
 
498 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  26.22 
 
 
496 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  28.73 
 
 
498 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  25.28 
 
 
495 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  28.49 
 
 
498 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  27.37 
 
 
492 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  25.66 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  28.07 
 
 
484 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  25.77 
 
 
501 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  24.62 
 
 
459 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  28.83 
 
 
491 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 
470 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  35.39 
 
 
271 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  24.38 
 
 
459 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  27.32 
 
 
489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
267 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  35.5 
 
 
271 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  24.58 
 
 
482 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  22.62 
 
 
497 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  35 
 
 
620 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.48 
 
 
263 aa  130  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.7 
 
 
269 aa  127  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.2 
 
 
260 aa  125  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2311  ABC transporter related  23.87 
 
 
534 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  33.19 
 
 
275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  31.22 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  27.21 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  27.21 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
266 aa  121  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  33.6 
 
 
275 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  32.43 
 
 
260 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  36.19 
 
 
283 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  32.43 
 
 
260 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
269 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.31 
 
 
260 aa  120  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  36.12 
 
 
336 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  24.82 
 
 
504 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  26.02 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2738  ABC transporter related protein  28.34 
 
 
520 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  28.05 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  35.24 
 
 
262 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4323  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
507 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.02 
 
 
264 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 
275 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.44 
 
 
272 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  26.39 
 
 
531 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.76 
 
 
274 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  26 
 
 
524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  34.48 
 
 
262 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  26.19 
 
 
529 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  27.99 
 
 
582 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.71 
 
 
263 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  36.24 
 
 
261 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
261 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2700  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  26.16 
 
 
503 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
263 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  29.37 
 
 
507 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  31.4 
 
 
262 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  26.33 
 
 
519 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>