More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2704 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  100 
 
 
497 aa  1017    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  62.99 
 
 
489 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  62.68 
 
 
485 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
490 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.84 
 
 
490 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.88 
 
 
490 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  44.26 
 
 
490 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.19 
 
 
488 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.84 
 
 
490 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.84 
 
 
490 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  45.22 
 
 
490 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  45.77 
 
 
491 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.84 
 
 
490 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.74 
 
 
489 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.15 
 
 
491 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.15 
 
 
491 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.15 
 
 
491 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.15 
 
 
491 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  43.36 
 
 
491 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  45.65 
 
 
490 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  44.64 
 
 
496 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  44.25 
 
 
497 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  44.25 
 
 
496 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  44.66 
 
 
491 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  41.79 
 
 
475 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  38.63 
 
 
497 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  39.29 
 
 
491 aa  319  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  38.2 
 
 
498 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  39.28 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  38.2 
 
 
498 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  37.98 
 
 
498 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  37.12 
 
 
495 aa  312  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  37.12 
 
 
495 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
470 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  37.9 
 
 
498 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  36.86 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  38.22 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  36.91 
 
 
459 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  36.2 
 
 
459 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  33.94 
 
 
499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  33.54 
 
 
489 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  34.22 
 
 
413 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  32.74 
 
 
500 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  33.12 
 
 
497 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
482 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 
501 aa  209  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  47.83 
 
 
198 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.92 
 
 
494 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  30.71 
 
 
514 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.41 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  33.06 
 
 
483 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  31.69 
 
 
636 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  34.24 
 
 
501 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  29.71 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  33.4 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  34.81 
 
 
478 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  29.74 
 
 
500 aa  163  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
260 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.74 
 
 
263 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  26.64 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  33.33 
 
 
275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  35.65 
 
 
275 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  25.56 
 
 
541 aa  126  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
275 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.88 
 
 
260 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.88 
 
 
260 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.35 
 
 
274 aa  123  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  36.61 
 
 
280 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  24.14 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  34.38 
 
 
269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  25.83 
 
 
913 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  26.19 
 
 
913 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  25.83 
 
 
913 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  25.62 
 
 
913 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  25.47 
 
 
927 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  24.22 
 
 
935 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
260 aa  115  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  26.61 
 
 
579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  25.31 
 
 
926 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  32.43 
 
 
271 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  24.48 
 
 
911 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  24.48 
 
 
911 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  24.48 
 
 
911 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  24.48 
 
 
911 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  24.48 
 
 
911 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  24.48 
 
 
911 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  24.48 
 
 
911 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  24.48 
 
 
911 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  26.12 
 
 
912 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
267 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  26.11 
 
 
912 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  24.48 
 
 
911 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  26.27 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  25.72 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  25 
 
 
927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  27.82 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  25.87 
 
 
918 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  32.23 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.94 
 
 
260 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>