More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1451 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  42.08 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  41.02 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  40.78 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  39.45 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  41.18 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  41.57 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  40 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  40.23 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  38.91 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  38.96 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.5 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  37.55 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  35.71 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  35.94 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  39.08 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  31.52 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  31.35 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  30.35 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  32.11 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  31.47 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  33.97 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  34.13 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.83 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  34.54 
 
 		 562 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.24 
 
 		 636 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  30.6 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.2 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  32.45 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  33.72 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  31.54 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.27 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.03 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  31.45 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  30.62 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.2 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.6 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  30.5 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  31.27 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  29.26 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  31.15 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  33.74 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  30.65 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  29.73 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  31.78 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  29.46 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  30.27 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  31.78 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  31.4 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  29.01 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  30.92 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  34.75 
 
 		 514 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  31.18 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  30.65 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  30.19 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  31.3 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  27.52 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  31.98 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  29.48 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.2 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  31.25 
 
 		 620 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  33.87 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  31.95 
 
 		 483 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  33.47 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  30.77 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  31.71 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  30.77 
 
 		 479 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  28 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  31.62 
 
 		 478 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  29.41 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.55 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  32.26 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  32.34 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  35.19 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  31.62 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  35.19 
 
 		 497 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 494 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  32.07 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  32.07 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  30.47 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  30.19 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  30.2 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  30.4 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  30.51 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>