More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2850 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  100 
 
 
500 aa  992    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
494 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  33.07 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  34.75 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 
478 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  35.02 
 
 
483 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  32.84 
 
 
474 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  29.62 
 
 
562 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  31.34 
 
 
501 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  29.74 
 
 
497 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.22 
 
 
490 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  28.48 
 
 
489 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.69 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  25.75 
 
 
497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.17 
 
 
490 aa  153  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  27.08 
 
 
475 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.57 
 
 
491 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.96 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  28.75 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.96 
 
 
490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.75 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.84 
 
 
491 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.05 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.05 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.84 
 
 
491 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.54 
 
 
490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.54 
 
 
490 aa  146  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.63 
 
 
491 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  26.68 
 
 
488 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.63 
 
 
491 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.24 
 
 
489 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  25.54 
 
 
499 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.78 
 
 
497 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.78 
 
 
496 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.55 
 
 
490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.09 
 
 
496 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  27.63 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  28.72 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  26.37 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  25.91 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  28.54 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.15 
 
 
280 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  28.28 
 
 
921 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  26.82 
 
 
932 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  27.35 
 
 
459 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.78 
 
 
913 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  27.35 
 
 
943 aa  124  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  35.09 
 
 
620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  27.35 
 
 
930 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  26.42 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  26.96 
 
 
914 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  31.22 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  25.49 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
470 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  27.67 
 
 
484 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  28.48 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  28.8 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
265 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  33.47 
 
 
322 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 
260 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  26.68 
 
 
919 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  28.48 
 
 
495 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  29.3 
 
 
271 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  30.56 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  33.89 
 
 
320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  28.53 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  33.63 
 
 
308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 
263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  25.65 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  29.26 
 
 
243 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  28.21 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  28.21 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  28.04 
 
 
498 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  32.11 
 
 
257 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  26.98 
 
 
536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  31.02 
 
 
274 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.51 
 
 
310 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.02 
 
 
916 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
516 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  31.2 
 
 
280 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.86 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  31.89 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  28 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  34.16 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  28.38 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  28.24 
 
 
489 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  33.2 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  34.16 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  29.87 
 
 
278 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.46 
 
 
916 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  28.66 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  30.41 
 
 
241 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  28.38 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  23.03 
 
 
497 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.28 
 
 
495 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  26.52 
 
 
510 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  33.05 
 
 
304 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>