More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1242 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  100 
 
 
306 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  79.49 
 
 
274 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
261 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  57.85 
 
 
272 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  58.85 
 
 
262 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  59.69 
 
 
273 aa  291  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  62.02 
 
 
268 aa  289  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  59.77 
 
 
264 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  59.14 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  57.74 
 
 
271 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  58.37 
 
 
278 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  58.27 
 
 
261 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  52.45 
 
 
270 aa  277  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  58.62 
 
 
291 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  58.27 
 
 
261 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
265 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  57.53 
 
 
264 aa  276  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  57.54 
 
 
263 aa  275  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  55.64 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  59.15 
 
 
276 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  56.92 
 
 
266 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  54.65 
 
 
278 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  55.6 
 
 
270 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  53.64 
 
 
280 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  54.72 
 
 
290 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  54.72 
 
 
290 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  54.72 
 
 
290 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  53.7 
 
 
273 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  55.08 
 
 
274 aa  258  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  53.03 
 
 
286 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
261 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
261 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  54.26 
 
 
284 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  54.55 
 
 
287 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  51.94 
 
 
277 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
271 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  40.15 
 
 
262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  48.97 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.5 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  44.75 
 
 
259 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  44.75 
 
 
259 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  45.14 
 
 
259 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
260 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
265 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 
260 aa  185  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  36.86 
 
 
275 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  41.18 
 
 
275 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 
264 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  39.1 
 
 
264 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.22 
 
 
263 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.88 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.6 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.88 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  38.82 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.42 
 
 
264 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  36.92 
 
 
262 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.07 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  34.3 
 
 
265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  27.97 
 
 
266 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.88 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  30.31 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  26.27 
 
 
262 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  33.96 
 
 
272 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  31.28 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  36.61 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  28.26 
 
 
268 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
267 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  31.33 
 
 
500 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  30.17 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  26.56 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  22.83 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  43.27 
 
 
479 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25.09 
 
 
270 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
393 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.6 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  34.47 
 
 
290 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  28.81 
 
 
258 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  31.82 
 
 
265 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  31.91 
 
 
261 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.09 
 
 
636 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
482 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  28.11 
 
 
326 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  26.27 
 
 
253 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 
263 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.85 
 
 
262 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  31.38 
 
 
384 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.16 
 
 
269 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  29.83 
 
 
499 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  36.76 
 
 
273 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  27.02 
 
 
321 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
274 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  28.86 
 
 
263 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  30.86 
 
 
254 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  30.43 
 
 
269 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  26.72 
 
 
321 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>