More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0041 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  74.23 
 
 		 290 aa  358  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  44.36 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  41.29 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  41.95 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  42.31 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  39.23 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  41.09 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  41.15 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  41.5 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  40.56 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  38.13 
 
 		 265 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  39.84 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  31.47 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.4 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  37.88 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  33.2 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  39.85 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  42.08 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  37.26 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  29.48 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  39.16 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  28.12 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  37.4 
 
 		 264 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.3 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.36 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  38.46 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  38.16 
 
 		 303 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  34.66 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  35.09 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  36.5 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  28.79 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  28.12 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  37.93 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  29.27 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  38.08 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.15 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  36.19 
 
 		 562 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.21 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  38.08 
 
 		 479 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 		 478 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  35.07 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  37.24 
 
 		 479 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  37.22 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  37.69 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  30.74 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  37.25 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  32.82 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  30.89 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  37.36 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  36.5 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  30.89 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  37.55 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  36.6 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  34.23 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  34.23 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  34.23 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  36.93 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  34.65 
 
 		 636 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  29.53 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.1 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  34.25 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  36.09 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  37.55 
 
 		 620 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  32.71 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 		 240 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  31.76 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  35.27 
 
 		 350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.08 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  33.18 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  32 
 
 		 419 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  28.91 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 494 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>