More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4096 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  66.02 
 
 
270 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  63.95 
 
 
261 aa  325  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  65.23 
 
 
264 aa  321  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  64.06 
 
 
264 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  64.98 
 
 
264 aa  317  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  63.18 
 
 
261 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  63.78 
 
 
261 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  63.78 
 
 
265 aa  314  8e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
261 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.28 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  61.54 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 
262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.48 
 
 
272 aa  311  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  63.53 
 
 
261 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  63.85 
 
 
303 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  64.06 
 
 
278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  63.46 
 
 
291 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  64.31 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  63.57 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  63.18 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  61.69 
 
 
286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  62.3 
 
 
276 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  57.48 
 
 
270 aa  295  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  60.62 
 
 
286 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  59.62 
 
 
274 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  57.75 
 
 
280 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  56.69 
 
 
278 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  57.94 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  56.64 
 
 
290 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  56.64 
 
 
290 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  56.64 
 
 
290 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  58.27 
 
 
284 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.73 
 
 
263 aa  275  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  56.69 
 
 
306 aa  262  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  56.32 
 
 
277 aa  261  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
272 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  42.19 
 
 
262 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  39.84 
 
 
275 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  39.57 
 
 
282 aa  195  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  42.91 
 
 
275 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  43.8 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  43.8 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  44.19 
 
 
259 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
265 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
260 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  41 
 
 
264 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  40.46 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.07 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  40.08 
 
 
280 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.75 
 
 
260 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  38.46 
 
 
260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  38.46 
 
 
260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
260 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  40.32 
 
 
262 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.75 
 
 
264 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.5 
 
 
265 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  35.83 
 
 
272 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  24.05 
 
 
262 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  34.77 
 
 
261 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  23.95 
 
 
262 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  27.34 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.55 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.88 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.06 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25.78 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.01 
 
 
263 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 
290 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  23.53 
 
 
262 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.33 
 
 
269 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  38.56 
 
 
636 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  26.72 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  27.61 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  29.66 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  44.12 
 
 
479 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  29.07 
 
 
271 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  33.46 
 
 
272 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  32.64 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  35.02 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  34.78 
 
 
500 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  35.43 
 
 
384 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  30.77 
 
 
262 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  26.56 
 
 
262 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  34.08 
 
 
497 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  29.07 
 
 
268 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  33.07 
 
 
265 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  28.02 
 
 
271 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  32.43 
 
 
336 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  30.17 
 
 
266 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.18 
 
 
269 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.98 
 
 
269 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
485 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
254 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  35.04 
 
 
273 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>