More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3500 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  80.86 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  59.62 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  59.62 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  57.53 
 
 		 261 aa  298  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  61.09 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  61.39 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  57.41 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  59.62 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  61.63 
 
 		 268 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  58.91 
 
 		 273 aa  284  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  59.14 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  59.53 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  57.94 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.75 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  58.2 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  56.69 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  53.54 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  55.6 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  54.65 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  56.08 
 
 		 265 aa  268  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  55.51 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  58.72 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  56.59 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  55.47 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  54.47 
 
 		 273 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  55.21 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  54.94 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  54.47 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  52.76 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  52.76 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  52.76 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  51.55 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  39.77 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.86 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  42.42 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  42.42 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  41.94 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  39.85 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  38.04 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.25 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  39.23 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  39.7 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.33 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  35.52 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  35.52 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  37.69 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.08 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.07 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.08 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.8 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  26.64 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  29.92 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.52 
 
 		 636 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  42.79 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  30.97 
 
 		 500 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  28.24 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.74 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.2 
 
 		 494 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25.59 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  24.4 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  36.6 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.74 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  32.3 
 
 		 500 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.72 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  22.75 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  33.85 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  34.82 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  35.63 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  33.2 
 
 		 421 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  28.22 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  26.74 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  32.33 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  32.42 
 
 		 497 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  21.9 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  29.45 
 
 		 455 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  29.07 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  29.41 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  23.51 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.55 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>