More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1562 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  98.84 
 
 
259 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  67.98 
 
 
265 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  62.85 
 
 
270 aa  298  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  59.53 
 
 
264 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  53.49 
 
 
264 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  53.88 
 
 
264 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
271 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  51.64 
 
 
272 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  47.67 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
261 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  45.35 
 
 
273 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  44.88 
 
 
306 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
261 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  44.36 
 
 
264 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  47.29 
 
 
291 aa  191  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.27 
 
 
264 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
278 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  44.62 
 
 
286 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
265 aa  188  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  42.42 
 
 
274 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  44.57 
 
 
262 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  42.35 
 
 
280 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.98 
 
 
272 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  45.74 
 
 
303 aa  185  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  43.46 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  43.61 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  40.77 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
266 aa  181  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  42.53 
 
 
264 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  45.77 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  43.92 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
277 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  41.2 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  41.2 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  41.2 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  40.77 
 
 
261 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  40.68 
 
 
263 aa  175  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
284 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  38.61 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  43.68 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  39.62 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
271 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  41.53 
 
 
287 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  42.05 
 
 
286 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  37.06 
 
 
282 aa  164  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  36.82 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  36.82 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  38.61 
 
 
280 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  34.24 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  38.75 
 
 
275 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.96 
 
 
263 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  31.95 
 
 
266 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.25 
 
 
260 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.76 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  41.7 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  34.4 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.69 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.33 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  35.54 
 
 
265 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  31.95 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  26.59 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  26.19 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.46 
 
 
269 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  27.17 
 
 
270 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  25 
 
 
262 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  32.54 
 
 
262 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  28.63 
 
 
258 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  32.82 
 
 
272 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  33.47 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  28.06 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 
256 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  34.66 
 
 
250 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  31.66 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  35.83 
 
 
272 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  31.22 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  33.47 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  36.29 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.21 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  30.86 
 
 
405 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  31.91 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  31.95 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  30.92 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  29.07 
 
 
263 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 
261 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  38.03 
 
 
514 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  35.38 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.15 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  34.87 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>