More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1055 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1055  ATPase  100 
 
 		 514 aa  1042    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  45.39 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  42.02 
 
 		 636 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 494 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  37.86 
 
 		 501 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  34.93 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  33.87 
 
 		 500 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  35.73 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  32.28 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  28.6 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  28.98 
 
 		 475 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  30.71 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.08 
 
 		 491 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.81 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.34 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.37 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.85 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.45 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.98 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.85 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  27.98 
 
 		 491 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  28.11 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.23 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.43 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.43 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.81 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.81 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.43 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.27 
 
 		 490 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.88 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  26.96 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.45 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.23 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.23 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  29.29 
 
 		 498 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  28.72 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  28.89 
 
 		 498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  29.09 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  28.89 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  29.02 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  29.11 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  28.6 
 
 		 495 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  26.69 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  28.6 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  29.97 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  28.6 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  28.81 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  24.9 
 
 		 497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  27.74 
 
 		 470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  26.3 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  26.33 
 
 		 459 aa  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  38.66 
 
 		 620 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  25.53 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.04 
 
 		 274 aa  121  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  23.62 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  26.57 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  22.7 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  32.75 
 
 		 260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  24.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  25.46 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  28.19 
 
 		 906 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.08 
 
 		 260 aa  118  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.45 
 
 		 269 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.88 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 266 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  24.95 
 
 		 481 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  28.92 
 
 		 933 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  38.03 
 
 		 259 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.93 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  28.19 
 
 		 906 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.94 
 
 		 906 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  27.42 
 
 		 925 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  38.03 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  38.03 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.48 
 
 		 269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  34.92 
 
 		 278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  31.91 
 
 		 271 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  29.84 
 
 		 266 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  27.88 
 
 		 524 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  30.4 
 
 		 271 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  34.62 
 
 		 198 aa  113  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  36.29 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  25.96 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  32.8 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  28.97 
 
 		 901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  28.97 
 
 		 901 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.2 
 
 		 263 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  31.12 
 
 		 262 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.05 
 
 		 270 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  33.78 
 
 		 280 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  35.4 
 
 		 262 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  31.91 
 
 		 261 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  37.24 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  33.76 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  23.06 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  28.85 
 
 		 912 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>