More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05449 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  84.26 
 
 
484 aa  353  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  80 
 
 
489 aa  331  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  70.65 
 
 
470 aa  287  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  70.11 
 
 
495 aa  286  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  70.11 
 
 
495 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  70.11 
 
 
496 aa  286  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  70.11 
 
 
498 aa  283  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  70.11 
 
 
498 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  70.11 
 
 
498 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  69.02 
 
 
498 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  71.2 
 
 
492 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  55.08 
 
 
491 aa  227  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  56.99 
 
 
490 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  56.04 
 
 
488 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  57.38 
 
 
491 aa  214  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  56.22 
 
 
490 aa  214  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
491 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
491 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
491 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
491 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
491 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.38 
 
 
490 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
485 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  57.38 
 
 
491 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.38 
 
 
490 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.38 
 
 
490 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  54.84 
 
 
490 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  54.84 
 
 
490 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
490 aa  211  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  54.59 
 
 
475 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  54.84 
 
 
489 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  54.3 
 
 
490 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  51.89 
 
 
497 aa  208  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
497 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
496 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  55.74 
 
 
496 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  51.09 
 
 
489 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  54.89 
 
 
459 aa  204  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  53.26 
 
 
459 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  47.83 
 
 
497 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  43.35 
 
 
413 aa  164  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  44.44 
 
 
497 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  42.39 
 
 
499 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  42.02 
 
 
500 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
482 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  34.62 
 
 
514 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
501 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  34.76 
 
 
262 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  32.07 
 
 
636 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  32.18 
 
 
562 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.48 
 
 
263 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
494 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
260 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  31.79 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  31.79 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  32.28 
 
 
271 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.29 
 
 
269 aa  92  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  30.16 
 
 
336 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.28 
 
 
269 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  32.11 
 
 
275 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  32.8 
 
 
280 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
255 aa  87.8  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  32.62 
 
 
265 aa  87.8  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  32.42 
 
 
501 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
254 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  30.18 
 
 
262 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  31.75 
 
 
271 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  32.95 
 
 
239 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 
275 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.61 
 
 
270 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  31.82 
 
 
259 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  31.82 
 
 
259 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  31.82 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  34.9 
 
 
541 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  33.72 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.33 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  30.43 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.95 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  35.42 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.61 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  32.77 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
267 aa  82  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  28.99 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  30.46 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.53 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.71 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  32.9 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  31.03 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  32.02 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  28.89 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  35.12 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  26.52 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  32.99 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>