More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3635 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
501 aa  1040    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  37.28 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  38.62 
 
 
500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  38.04 
 
 
497 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.64 
 
 
490 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.64 
 
 
490 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.44 
 
 
490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
490 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.44 
 
 
490 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.23 
 
 
490 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.23 
 
 
490 aa  257  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  32.39 
 
 
475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.35 
 
 
491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.15 
 
 
491 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.15 
 
 
491 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.15 
 
 
491 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.94 
 
 
491 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.81 
 
 
496 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.81 
 
 
497 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.81 
 
 
496 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.92 
 
 
488 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  34.1 
 
 
489 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
482 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  32.07 
 
 
491 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.45 
 
 
489 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.88 
 
 
490 aa  237  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.76 
 
 
490 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.69 
 
 
491 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.68 
 
 
491 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  31.41 
 
 
497 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  32.72 
 
 
485 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  33.77 
 
 
489 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  29.65 
 
 
484 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  34.1 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  33.8 
 
 
496 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  32.09 
 
 
498 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  32.09 
 
 
498 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  32.11 
 
 
495 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  32.35 
 
 
498 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  32.24 
 
 
495 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  32.09 
 
 
498 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
470 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  28.69 
 
 
459 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  31.2 
 
 
492 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  28.03 
 
 
459 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  26.46 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  25.15 
 
 
494 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  25.41 
 
 
562 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  25.78 
 
 
483 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  25.85 
 
 
479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  27.38 
 
 
541 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  25.91 
 
 
500 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  27.43 
 
 
501 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  25.53 
 
 
514 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  25.1 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  30.07 
 
 
543 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  25.38 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  37.07 
 
 
198 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  23.62 
 
 
914 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  25.09 
 
 
810 aa  126  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.27 
 
 
770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  20.79 
 
 
925 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  22.29 
 
 
933 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  22.72 
 
 
932 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  28.64 
 
 
756 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  24.44 
 
 
557 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
260 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  24.85 
 
 
484 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  22.7 
 
 
921 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  21.61 
 
 
548 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  21.97 
 
 
901 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  25.71 
 
 
551 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  22.75 
 
 
936 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  23.57 
 
 
922 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  22.75 
 
 
936 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  24.33 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  22.77 
 
 
928 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  22.97 
 
 
926 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  24.62 
 
 
904 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  22.81 
 
 
912 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  23.63 
 
 
489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  22.88 
 
 
930 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.52 
 
 
906 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  23.31 
 
 
929 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  24.4 
 
 
500 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.66 
 
 
573 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.15 
 
 
907 aa  113  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  23.52 
 
 
906 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  23.12 
 
 
906 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.12 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  23.76 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  22.87 
 
 
924 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  23.03 
 
 
942 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  24.86 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  29.27 
 
 
636 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  23.96 
 
 
527 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  24.18 
 
 
510 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.65 
 
 
568 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  23.9 
 
 
495 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.83 
 
 
568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>