More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0162 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  100 
 
 		 499 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  40.66 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 501 aa  339  8e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  35.63 
 
 		 497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36 
 
 		 497 aa  276  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.79 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.23 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.44 
 
 		 490 aa  272  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.23 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.23 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  33.94 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.23 
 
 		 490 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.02 
 
 		 490 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.13 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  33.27 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.6 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  31.31 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.27 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.8 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.62 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.62 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.62 
 
 		 491 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.93 
 
 		 491 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  34.18 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  30.8 
 
 		 491 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.12 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  32.14 
 
 		 491 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  35.75 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  35.99 
 
 		 496 aa  226  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 484 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  37.22 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  31.86 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  35.57 
 
 		 489 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  33.42 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  35.64 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  35.81 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  35.64 
 
 		 495 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  34.7 
 
 		 492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  29.8 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  31.38 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  27.64 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  26.96 
 
 		 494 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  26.69 
 
 		 459 aa  190  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  26.96 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  23.96 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  32.49 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  27.47 
 
 		 479 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  42.39 
 
 		 198 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  27.65 
 
 		 541 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  26.65 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  25.54 
 
 		 500 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  27.38 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  25.55 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  26.29 
 
 		 756 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.08 
 
 		 260 aa  127  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.08 
 
 		 260 aa  127  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  25.58 
 
 		 916 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  22.91 
 
 		 920 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  25.4 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.56 
 
 		 914 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  32.3 
 
 		 275 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  22.2 
 
 		 918 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  22.8 
 
 		 932 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  22.33 
 
 		 922 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.36 
 
 		 907 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  23.39 
 
 		 933 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  23.62 
 
 		 928 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  22.76 
 
 		 921 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  24.01 
 
 		 927 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  23.58 
 
 		 994 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  22.81 
 
 		 914 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  22.94 
 
 		 930 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  23.18 
 
 		 906 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  31.25 
 
 		 636 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  23.52 
 
 		 926 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  22.87 
 
 		 942 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  23.05 
 
 		 925 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  23.35 
 
 		 922 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  22.22 
 
 		 924 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  23.03 
 
 		 904 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  21.91 
 
 		 915 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  22.48 
 
 		 943 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.11 
 
 		 906 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.22 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  23.34 
 
 		 906 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  22.09 
 
 		 901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  28.87 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  21.96 
 
 		 919 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  21.75 
 
 		 912 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  22.15 
 
 		 921 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  28.44 
 
 		 270 aa  110  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  22.35 
 
 		 906 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.65 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  22.48 
 
 		 930 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>