More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0654 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  99 
 
 
498 aa  1002    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  89.69 
 
 
470 aa  837    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  98.8 
 
 
498 aa  1001    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  86.54 
 
 
495 aa  850    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  86.19 
 
 
495 aa  852    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  86.39 
 
 
496 aa  853    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  100 
 
 
498 aa  1012    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  85.37 
 
 
492 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  97.79 
 
 
498 aa  989    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  53.02 
 
 
489 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  52.62 
 
 
484 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  42.98 
 
 
475 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  42.51 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.83 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.72 
 
 
489 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.82 
 
 
491 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39 
 
 
490 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  36.45 
 
 
489 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.01 
 
 
490 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.2 
 
 
490 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.92 
 
 
496 aa  316  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.74 
 
 
491 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.99 
 
 
490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.71 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.78 
 
 
490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
490 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  38.2 
 
 
497 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.71 
 
 
497 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.13 
 
 
491 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.13 
 
 
491 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.72 
 
 
491 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.13 
 
 
491 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.13 
 
 
491 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.57 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.57 
 
 
490 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  39.52 
 
 
491 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
485 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  70.11 
 
 
198 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  35.91 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  33.82 
 
 
497 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  35.53 
 
 
459 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  37.22 
 
 
499 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  36.27 
 
 
497 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  34.56 
 
 
500 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  29.25 
 
 
482 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  31.74 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 
501 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  29.09 
 
 
514 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  28.48 
 
 
494 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  30.12 
 
 
636 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  29 
 
 
562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  29.93 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  30.82 
 
 
479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  31.03 
 
 
478 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  27.63 
 
 
635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  27.25 
 
 
541 aa  126  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.55 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  30.48 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  30.6 
 
 
543 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  37.5 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  31.86 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  28.21 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  27.32 
 
 
756 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  35.12 
 
 
262 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  32.61 
 
 
260 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  32.61 
 
 
260 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  27.69 
 
 
501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  29.02 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 
275 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
260 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.72 
 
 
271 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.33 
 
 
265 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  27.39 
 
 
275 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 
269 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.44 
 
 
260 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
266 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  29.2 
 
 
263 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  30.63 
 
 
270 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
266 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  32.27 
 
 
273 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  30.77 
 
 
271 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.91 
 
 
260 aa  101  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.41 
 
 
274 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 
267 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.01 
 
 
907 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
271 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  32.34 
 
 
257 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  30.7 
 
 
283 aa  96.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.37 
 
 
263 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  29.33 
 
 
291 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.47 
 
 
269 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  29.75 
 
 
271 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  31.28 
 
 
282 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 
256 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  29.26 
 
 
336 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  28.08 
 
 
269 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.78 
 
 
270 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  30.09 
 
 
265 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 
261 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  29.68 
 
 
278 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>