More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0842 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  88.45 
 
 		 490 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  98.98 
 
 		 491 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  71.81 
 
 		 489 aa  710    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  82.85 
 
 		 490 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  88.25 
 
 		 490 aa  881    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  88.45 
 
 		 490 aa  883    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  74.38 
 
 		 491 aa  744    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  99.39 
 
 		 491 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  76.03 
 
 		 490 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  88.66 
 
 		 490 aa  884    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  99.19 
 
 		 491 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  88.25 
 
 		 490 aa  881    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  87.55 
 
 		 490 aa  880    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.55 
 
 		 496 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  100 
 
 		 491 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.76 
 
 		 496 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  98.37 
 
 		 491 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.76 
 
 		 497 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  71.72 
 
 		 488 aa  715    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  73.55 
 
 		 491 aa  728    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  86.94 
 
 		 490 aa  878    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  43.9 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  43.36 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  44.2 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  41.47 
 
 		 491 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  39.41 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  38.99 
 
 		 498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  39.13 
 
 		 498 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  39.2 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  39.06 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  37.32 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  40.17 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  38.77 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  38.84 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  37.02 
 
 		 497 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  37.22 
 
 		 459 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  34.18 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  32.62 
 
 		 500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  33.62 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  33.26 
 
 		 497 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  55.74 
 
 		 198 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  27.98 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.08 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  30.05 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  29.05 
 
 		 562 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  31.48 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  30.94 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  32.02 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  30.61 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  29.05 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  31.01 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.45 
 
 		 916 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  34.07 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  28.49 
 
 		 915 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.52 
 
 		 914 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  27.56 
 
 		 922 aa  126  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  29.38 
 
 		 543 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  26.79 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.16 
 
 		 916 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  30.54 
 
 		 926 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  34.76 
 
 		 260 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  34.76 
 
 		 260 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  28.22 
 
 		 929 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  28.13 
 
 		 912 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  28.6 
 
 		 943 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  28.25 
 
 		 930 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  32.38 
 
 		 275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  25.66 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  27.59 
 
 		 901 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  26.34 
 
 		 918 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  27.97 
 
 		 927 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  30.32 
 
 		 756 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  27.55 
 
 		 901 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  27.59 
 
 		 901 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  27.7 
 
 		 635 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 		 930 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  27.45 
 
 		 930 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  29.02 
 
 		 543 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  27.9 
 
 		 911 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  28.63 
 
 		 921 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.89 
 
 		 770 aa  117  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.78 
 
 		 907 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.98 
 
 		 263 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  27.62 
 
 		 928 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  27.35 
 
 		 933 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  27.9 
 
 		 919 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  26.88 
 
 		 935 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  28.75 
 
 		 916 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  26.93 
 
 		 912 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  27.2 
 
 		 942 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  28.09 
 
 		 912 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>