More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1736 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  100 
 
 		 483 aa  927    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  40.22 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  40.42 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  35.02 
 
 		 500 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  34.54 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  32.84 
 
 		 562 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  30.89 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  33.06 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  29.62 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  32.09 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.56 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.43 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.48 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  27.8 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.04 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.04 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.04 
 
 		 497 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.12 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.92 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.69 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.28 
 
 		 490 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.71 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.75 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  31.85 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.4 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.61 
 
 		 491 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.61 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.4 
 
 		 491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.28 
 
 		 489 aa  148  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  30.4 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  29.07 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  41.78 
 
 		 620 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  26.37 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  25.78 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  25.55 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  35.65 
 
 		 271 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  26.22 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  31.45 
 
 		 944 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  28.92 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.76 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  30.48 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  30.48 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  30.48 
 
 		 498 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  26.68 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  28.11 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  26.68 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  29.83 
 
 		 498 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  27.29 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  30.13 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.46 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  29.53 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 275 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  35.24 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  26.72 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.04 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.39 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  27.03 
 
 		 915 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.8 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  41.7 
 
 		 268 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  27.44 
 
 		 509 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  23.98 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.05 
 
 		 913 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 280 aa  110  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  30.83 
 
 		 827 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  27.86 
 
 		 994 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  28.02 
 
 		 921 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  29.32 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  27.82 
 
 		 914 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  27.77 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  32.31 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  30.81 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  30.1 
 
 		 823 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  27.31 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  29.01 
 
 		 901 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  26.94 
 
 		 925 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  30.13 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.38 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  30.67 
 
 		 265 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  27.44 
 
 		 906 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.02 
 
 		 266 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  29.07 
 
 		 901 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  26.95 
 
 		 933 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  27.18 
 
 		 904 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 263 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  26.93 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  39.72 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  28.25 
 
 		 930 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  25.68 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  41.04 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  29.04 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  28.91 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 		 255 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>