More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2897 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  66.8 
 
 
264 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  66.28 
 
 
261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  65.89 
 
 
261 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  66.54 
 
 
273 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  67.05 
 
 
264 aa  322  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  65.37 
 
 
262 aa  318  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  67.57 
 
 
278 aa  317  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  66.15 
 
 
271 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  66.67 
 
 
276 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  66.93 
 
 
263 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  64.45 
 
 
261 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  64.45 
 
 
265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  64.79 
 
 
303 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  63.18 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  66.02 
 
 
286 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  64.2 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  64.31 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.28 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.36 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  65.23 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  64.84 
 
 
291 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  64.98 
 
 
261 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  61.57 
 
 
273 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  59.53 
 
 
270 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  62.26 
 
 
286 aa  292  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  61.63 
 
 
274 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  58.46 
 
 
280 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  61.96 
 
 
306 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  57.65 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  59.29 
 
 
287 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
284 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  56.75 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  56.75 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  56.75 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  55.81 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  45.52 
 
 
282 aa  220  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 
264 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  46.15 
 
 
264 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  42.13 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  40.16 
 
 
275 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
265 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  45.77 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  45.77 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
270 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  45.77 
 
 
259 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  42.39 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.33 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  46.56 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
260 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
260 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  39.78 
 
 
275 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  37.35 
 
 
260 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  37.35 
 
 
260 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.07 
 
 
260 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  41.41 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  35.36 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  32.42 
 
 
262 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.02 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 
263 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 
261 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  35.07 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  36.64 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  28.11 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  39.57 
 
 
636 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  32.83 
 
 
271 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.23 
 
 
271 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  24.3 
 
 
262 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25.79 
 
 
262 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  36.89 
 
 
271 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.22 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  36.78 
 
 
272 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  37.93 
 
 
273 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  28.02 
 
 
263 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  28.91 
 
 
263 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  26.92 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  35.39 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  26.29 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  26.48 
 
 
270 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  36.14 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.17 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  36.08 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  32.78 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  34.71 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.52 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.9 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  34.23 
 
 
265 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  29.84 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  35.6 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  36.17 
 
 
514 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  41.7 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>