More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0726 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 470 aa  963    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  89.35 
 
 		 495 aa  844    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  89.13 
 
 		 495 aa  843    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  89.69 
 
 		 498 aa  837    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  89.72 
 
 		 496 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  89.69 
 
 		 498 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  89.47 
 
 		 498 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  89.91 
 
 		 498 aa  841    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  84.25 
 
 		 492 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  53.73 
 
 		 489 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  43.61 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.72 
 
 		 490 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  37.26 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.4 
 
 		 490 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.57 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  37.12 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.47 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.57 
 
 		 490 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.35 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  41.04 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.35 
 
 		 490 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.13 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  40 
 
 		 491 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.91 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.91 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.45 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.45 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.45 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.45 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.94 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.07 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.85 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.66 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.85 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  70.65 
 
 		 198 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  34.7 
 
 		 497 aa  262  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  36.08 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  34.38 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  38.38 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  33.42 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  33.99 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  31.25 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  28.19 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  27.74 
 
 		 514 aa  146  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  28.78 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  28.21 
 
 		 562 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.37 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  28.02 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  33.43 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  32.34 
 
 		 478 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  26.07 
 
 		 635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.32 
 
 		 263 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  29.36 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  28.54 
 
 		 756 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  29.1 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  29.5 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  36.11 
 
 		 280 aa  113  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.14 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  31.74 
 
 		 260 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  31.74 
 
 		 260 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  33.01 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  26.75 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  28.91 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 260 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.33 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  29.91 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  27.16 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.37 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.19 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  30.28 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  30.09 
 
 		 270 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  26.17 
 
 		 912 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  25.9 
 
 		 912 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.95 
 
 		 274 aa  100  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 266 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  25.9 
 
 		 912 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  30.59 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  29.68 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  30.85 
 
 		 276 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  27.59 
 
 		 269 aa  96.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  31.63 
 
 		 278 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  28.17 
 
 		 258 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 		 267 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  30.41 
 
 		 265 aa  96.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  31.84 
 
 		 257 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  31.43 
 
 		 273 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 271 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  29.77 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  30 
 
 		 272 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  29.38 
 
 		 282 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 		 260 aa  94.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 261 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>