More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4947 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  100 
 
 
482 aa  981    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  34.19 
 
 
500 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  33.6 
 
 
499 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  33.27 
 
 
497 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.59 
 
 
490 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.96 
 
 
490 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.18 
 
 
490 aa  256  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.38 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.38 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.29 
 
 
491 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.6 
 
 
491 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.33 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.5 
 
 
491 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.18 
 
 
490 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.5 
 
 
491 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.18 
 
 
490 aa  253  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.27 
 
 
491 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.5 
 
 
491 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.85 
 
 
491 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.59 
 
 
497 aa  250  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.55 
 
 
496 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  35.59 
 
 
496 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.04 
 
 
488 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  32.7 
 
 
475 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.42 
 
 
490 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  32.69 
 
 
497 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  30.62 
 
 
501 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  32.16 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  29.94 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  29.94 
 
 
498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  29.94 
 
 
498 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  31.38 
 
 
491 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  29.94 
 
 
498 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 
484 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
470 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  32.88 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  29.32 
 
 
495 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  29.32 
 
 
495 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  31.71 
 
 
485 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  29.11 
 
 
496 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  30.51 
 
 
497 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  31.04 
 
 
459 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  32.22 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  29.46 
 
 
459 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  31.77 
 
 
492 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  29.34 
 
 
541 aa  179  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  27.8 
 
 
494 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  27.61 
 
 
479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00561  ABC transporter, putative (Eurofung)  28.99 
 
 
756 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  27.33 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  26.58 
 
 
500 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  27.61 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1927  ABC transporter related  26.93 
 
 
474 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02390  hypothetical protein  30.15 
 
 
543 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.403461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  25 
 
 
562 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  37.23 
 
 
198 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  30.73 
 
 
483 aa  127  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  23.62 
 
 
514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  27.13 
 
 
484 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.44 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  25.1 
 
 
932 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
260 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
265 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
261 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.33 
 
 
263 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  25.58 
 
 
548 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  31.84 
 
 
262 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  27.35 
 
 
501 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.91 
 
 
263 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  25.67 
 
 
490 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  36.84 
 
 
268 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  27.73 
 
 
863 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  25.51 
 
 
859 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  24.95 
 
 
562 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  26.17 
 
 
912 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  25.59 
 
 
912 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  26.55 
 
 
454 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.45 
 
 
270 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  33.33 
 
 
306 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  26.63 
 
 
927 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25.7 
 
 
922 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.58 
 
 
264 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.6 
 
 
272 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  31.45 
 
 
264 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  27.22 
 
 
516 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  25.79 
 
 
929 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  31.05 
 
 
249 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  26.83 
 
 
822 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  25.05 
 
 
501 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  36.06 
 
 
346 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  35.32 
 
 
636 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.86 
 
 
272 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  24.49 
 
 
921 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.42 
 
 
467 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  33.8 
 
 
261 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  34.36 
 
 
276 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  35.19 
 
 
264 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
264 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>