More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2576 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  68.99 
 
 
264 aa  349  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  67.83 
 
 
272 aa  345  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  68.87 
 
 
265 aa  345  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  66.15 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  65.38 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  66.8 
 
 
268 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  66.02 
 
 
271 aa  331  7.000000000000001e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  64.5 
 
 
273 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  67.84 
 
 
278 aa  324  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  65.23 
 
 
266 aa  321  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.81 
 
 
270 aa  319  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  64.45 
 
 
262 aa  318  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  63.42 
 
 
273 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  59.92 
 
 
270 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  65.57 
 
 
276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  62.11 
 
 
280 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.63 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
261 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  63.14 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  63.53 
 
 
303 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  63.14 
 
 
286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  63.53 
 
 
291 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  62.3 
 
 
284 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  60.08 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  62 
 
 
287 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  59.52 
 
 
290 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  59.52 
 
 
290 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  59.52 
 
 
290 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
261 aa  295  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
277 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  62.75 
 
 
261 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  59.68 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  58.2 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  44.11 
 
 
264 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.07 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  38.37 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  38.46 
 
 
275 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  43.33 
 
 
275 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
272 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  41.57 
 
 
280 aa  184  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
265 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  42.53 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  42.53 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
260 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
260 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.94 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  38.06 
 
 
260 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  38.06 
 
 
260 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
270 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.85 
 
 
260 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
275 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.02 
 
 
264 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  34.38 
 
 
272 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  38.82 
 
 
262 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 
261 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  37.35 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  32.03 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.62 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.64 
 
 
263 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  29.55 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.4 
 
 
283 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  30 
 
 
500 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.06 
 
 
265 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  26.64 
 
 
262 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  34.63 
 
 
272 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 
267 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  30.47 
 
 
271 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  25.49 
 
 
262 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  26.92 
 
 
262 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  26 
 
 
270 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  28.63 
 
 
263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  26.56 
 
 
268 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.64 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25.2 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  29.66 
 
 
263 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  35.09 
 
 
636 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.08 
 
 
269 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  32.14 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  35.82 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  34.15 
 
 
270 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  35.66 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  36.05 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  31.3 
 
 
336 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  32.48 
 
 
514 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  35.66 
 
 
270 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  39.72 
 
 
483 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.14 
 
 
271 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  32.14 
 
 
255 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  35.34 
 
 
268 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  31.4 
 
 
269 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  28.46 
 
 
266 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>